学校研究生教育师资力量雄厚。拥有校内外硕士研究生导师1000余人，博士生导师40余人，其中：国际系统与控制科学院院士、国家“万人计划”人选、“新世纪百千万人才工程”国家级人选、国家级有突出贡献的中青年专家、全国杰出专业技术人才、全国文化名家暨“四个一批”理论人才、教育部科技委数理学部委员、“中国青年科技奖”获得者、享受国务院政府特殊津贴专家、“海外杰青”获得者、中国科学院“百人计划”人选等国家级专门人才30人次。有教育部重点人才工程人选、重庆市重点人才工程人选240余人次。
本部门主要负责全校学科建设、学位与研究生教育、研究生招生与就业、研究生日常管理与服务。目前设有综合办公室、研究生招生办公室、学位与学科建设科、培养与质量监控科、研究生教育管理科。
作为重庆市高层次人才培养的重要基地，部门始终坚持以学科为龙头，秉承以学科建设为核心，人才培养为主导、体制建设为保障的理念，全力推进学科建设，加强研究生培养模式改革和环节控制的管理，保障研究生教育的稳步发展。截止目前，共有近百篇硕士学位论文被评选为重庆市优秀硕士学位论文，居重庆市属高校前列；首批教育部研究生课程改革试点等，同时拥有重庆市研究生创新教育基地，20余门重庆市级研究生优质课程，100余项重庆市级研究生教改项目，为研究生创新教育和教学改革创造了良好的平台条件。
积极拓展研究生国际合作与对外交流，先后与澳大利亚科廷科技大学等多个国家和地区建立了研究生联合培养关系，努力探索国内外导师联合指导的研究生培养模式。同时，通过送培研究生和招收外国留学研究生等手段，拓宽了国际合作与对外交流渠道。
